Как определяется в положении, Министерство транспорта Республики Казахстан является государственным органом РК, осуществляющим руководство в сферах железнодорожного, автомобильного, внутреннего водного транспорта; торгового мореплавания; в области использования воздушного пространства Республики Казахстан и деятельности гражданской и экспериментальной авиации; естественных монополий в области услуг аэронавигации и аэропортов; общественно значимых рынков в области услуг аэропортов; автомобильных дорог.
В его состав предполагается включить следующие ведомства:
Комитет автомобильных дорог Министерства транспорта Республики Казахстан; Комитет гражданской авиации Министерства транспорта Республики Казахстан; Комитет транспорта Министерства транспорта Республики Казахстан.
В свою очередь, к подведомственным организациям министерства и его ведомств отнесены:
АО «Международный аэропорт Нурсултан Назарбаев»; АО «Национальная компания “КазАвтоЖол”; АО “Казахстанский дорожный научно-исследовательский институт”; Национальный центр качества дорожных активов; АО “Авиационная администрация Казахстана”; РГП “Казаэронавигация”; РГКП “Қазақстан су жолдары”.
